首尔大学:非典病毒-2 高分辨率蛋白质体图谱完成...为治疗剂开发做贡献
2021-06-03
基础科学研究院(IBS,院长卢道英)RNA研究团团长金光内里(首尔大学生命科学系教授)研究组发现了与冠状病毒RNA直接结合抑制增殖的蛋白质。通过此次研究,继绘制去年引发冠状病毒感染症-19(COVID-19)的非典病毒-2(SARS-CoV-2)的高分辨率基因图谱后,又完成了高分辨率蛋白质体图谱。这将对冠状19治疗剂的开发做出贡献。
冠状病毒是RNA病毒的一种。它通过侵入宿主细胞生产并翻译含有自身遗传信息的“基因组RNA”(genomic RNA),生成多个“非结构蛋白质(non-structural protein)”。非结构蛋白质可以阻断宿主细胞的第一次免疫攻击(先天免疫),并复制病毒基因。此后,在基因组RNA中就会生产出"下位基因RNA(subgenomic RNA)"。它起到构成病毒的各种"结构蛋白质(spike、外皮等)"设计图作用。 结构蛋白和基因组RNA制造病毒粒子,脱离原细胞后感染新细胞。
像这样,基因组RNA及下位基因组RNA结合,形成的宿主细胞的蛋白质在新冠病毒的繁殖中起着重要作用。 但是到目前为止,人们对这些蛋白质的了解还不多。
为了寻找与非典病毒-2特别结合的蛋白质,研究组开发出了只分离·同定与特定RNA结合的蛋白质的技术。 利用该技术,找到了与非典病毒-2RNA相结合的109个蛋白质。 其中37个是基因组RNA和下位基因组RNA相结合的蛋白质。
研究组还将其与新冠病毒的一种HCoV-OC43进行了比较分析。 他们对共同作用于新冠病毒蛋白质和只结合于非典病毒-2的蛋白质进行了分类,并分析了各自的功能。 结果发现了8种有助于病毒增殖的蛋白质和17种抗病毒蛋白质。 不仅查明了与非典病毒-2直接结合的所有蛋白质,还查明了它们对病毒增殖的影响。
并且通过基于RNA大数据的交叉分析,完成了宿主细胞与非典病毒-2之间的网络图谱。以理解病毒RNA中心的蛋白质分子之间的相互作用为基础,揭示了宿主细胞和病毒之间复杂的部分关系。例如,来自宿主细胞的LARP1(无SHIFTLESS)蛋白质会干扰病毒的蛋白质生成,从而阻止病毒的增殖。
通过此次研究,进一步提高了对冠状病毒增殖的了解。同时,还有望开发直接与非典病毒-2结合的蛋白质的抗病毒剂。
研究结果于4月27日(韩国时间)刊登在国际学术杂志《Molecular Cell(IF 15.584)》上。 与首尔大学蛋白质体研究室(教授金钟瑞)、国际疫苗研究所(事务总长杰罗姆·金)共同执行,并得到了科学技术信息通信部的支援。
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